Το ΕΚΕΜ, ως το καθ’ ύλην αρμόδιο ερευνητικό κέντρο για τα ευρωπαϊκά θέματα και στο πλαίσιο του Προγράμματος «Ευρώπη Παντού» αναλαμβάνει από κοινού δράσεις με την Αντιπροσωπεία της Ευρωπαϊκής Επιτροπής, το Γραφείο του Ευρωπαϊκού Κοινοβουλίου και τις πρεσβείες των κρατών-μελών της Ευρωπαϊκής Ένωσης στην Ελλάδα.

Το ΕΚΕΜ είναι μέλος του ελληνικού δικτύου του Ευρωμεσογειακού Ιδρύματος Anna Lindh για το Διάλογο μεταξύ των Πολιτισμών, που ιδρύθηκε το 2005 και στο οποίο συμμετέχουν τα 39 κράτη-μέλη της Ευρωμεσογειακής Συνεργασίας για την προώθηση του διαπολιτισμικού διαλόγου με εκπροσώπους της Κοινωνίας των Πολιτών. Το ΕΚΕΜ, στο πλαίσιο των δραστηριοτήτων του Μεσογειακού Παρατηρητηρίου, συμμετέχει ενεργά στις δράσεις του Ιδρύματος τόσο σε εθνικό, όσο και σε ευρωμεσογειακό επίπεδο.

Με στόχο τη βελτίωση και την ενίσχυση της πληροφόρησης, καθώς και την τόνωση του δημόσιου διαλόγου για τις νέες θεσμικές ρυθμίσεις της Ένωσης, οι οποίες προβλέπονται από τη Συνθήκη της Λισαβόνας, το ΕΚΕΜ συνεργάζεται με το Ευρωπαϊκό Ινστιτούτο Κύπρου (ΕΙΚ) στη σειρά δράσεων “Reform Treaty: what’s the need 4U…”. Οι συγκεκριμένες δράσεις πραγματοποιούνται στο πλαίσιο του Ευρωπαϊκού Προγράμματος «Ευρώπη για τους πολίτες» 2007-2013, Δράση 2- Ενεργός κοινωνία των πολιτών στην Ευρώπη, Μέτρο 3- Στήριξη σχεδίων για τις οργανώσεις της κοινωνίας των πολιτών.

Στο πλαίσιο του Προγράμματος Νοτιοανατολικής Ευρώπης, το EKEM είναι ιδρυτικό μέλος και συμμετέχει ενεργά στο “Balkan Network”, που αποτελείται από εικοσιένα (21) ερευνητικά κέντρα, εννέα (9) βαλκανικών χωρών (Αλβανία, Βοσνία-Ερζεγοβίνη, Βουλγαρία, Ελλάδα, Κροατία, πΓΔΜ, Σερβία, Ρουμανία και Τουρκία). Το δίκτυο υποστηρίζεται από τη Γενική Διεύθυνση της Ευρωπαϊκής Επιτροπής για τη Διεύρυνση. Κύριος άξονας των δραστηριοτήτων του είναι η προώθηση της επικοινωνίας καθώς και η ανάπτυξη μιας παραγωγικής συνεργασίας μεταξύ των ερευνητικών κέντρων, μέσω της ανάληψης κοινών πρωτοβουλιών, οι οποίες αποσκοπούν στην προώθηση της ευρωπαϊκής ολοκλήρωσης και τη μεταφορά τεχνογνωσίας σε θέματα ευρωπαϊκού ενδιαφέροντος.

Η συμβολή του ΕΚΕΜ στην επιστημονική έρευνα ενισχύεται από τη συνεργασία του με ευρεία ομάδα επιστημόνων και ακαδημαϊκών από ελληνικά και ξένα ερευνητικά κέντρα και Πανεπιστήμια. Στο πλαίσιο αυτό, διακεκριμένοι ερευνητικοί εταίροι του ΕΚΕΜ, οι οποίοι δεν είναι εγκατεστημένοι στην έδρα του και δεν αποζημιώνονται για το έργο τους είναι, μεταξύ άλλων, οι:

• George Tsebelis Professor of Political Sciences at the University of California
• Geoffrey Edwards, Professor of European Studies, University of Cambridge
• Mustafa Aydin, Professor of International Relations, University of Ankara